Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700014D04RikJ3QMS2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms