Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6594J3QM43 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms