Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm21060J3KMU4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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