Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm21411J3KMS0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm21411J3KMS0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm21411J3KMS0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm21411J3KMS0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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