Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Vmn1r67G5E8C1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms