Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcf11G3X9Z4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcf11G3X9Z4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms