Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nccrp1G3X9C2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms