Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610008E11RikG3X964 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
2610008E11RikG3X964 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms