Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Speer4cG3UXD1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Speer4cG3UXD1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms