Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34aG3UW52 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34aG3UW52 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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