Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r176G3UW31 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r176G3UW31 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms