Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm20517G3UVU6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20517G3UVU6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms