Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6F8VPZ5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6F8VPZ5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms