Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp9yF8VPU6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Usp9yF8VPU6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp9yF8VPU6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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