Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms