Protein–RNA interactions for Protein: F7BE40

Arl9, ADP-ribosylation factor-like 9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl9F7BE40 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arl9F7BE40 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arl9F7BE40 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms