Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms