Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox13F6YCR7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms