Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Gm10378F6XQQ1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Gm10378F6XQQ1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm10378F6XQQ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Gm10378F6XQQ1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Gm10378F6XQQ1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Gm10378F6XQQ1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Gm10378F6XQQ1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm10378F6XQQ1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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