Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5861F6VCN9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms