Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm6619F6URP1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm6619F6URP1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms