Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms