Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm28374F6SG70 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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