Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Syngap1F6SEU4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms