Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms