Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erich3F6QRE9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erich3F6QRE9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms