Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf165E9QAU8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf165E9QAU8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms