Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5407E9Q7Q1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms