Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Urb2E9Q7L1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms