Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itga10E9Q6R1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga10E9Q6R1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga10E9Q6R1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga10E9Q6R1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itga10E9Q6R1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms