Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Simc1E9Q6E9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Simc1E9Q6E9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms