Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms