Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp1E9Q368 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms