Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms