Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc171E9Q1U1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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