Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Zfp558E9Q1J0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp558E9Q1J0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp558E9Q1J0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Zfp558E9Q1J0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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