Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt78E9Q0F0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms