Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20425E9Q035 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20425E9Q035 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms