Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf11E9PZM7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms