Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3002E9PW72 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms