Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc144bE9PVZ3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms