Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifit3bE9PV48 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms