Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syde2E9PUP1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syde2E9PUP1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms