Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trim12cD3Z3L3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trim12cD3Z3L3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms