Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5930D3Z257 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms