Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfbr3lD3YZZ2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfbr3lD3YZZ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 785.5 ms