Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc6D3YZP9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc6D3YZP9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms