Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC048679D3YXE9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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BC048679D3YXE9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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