Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cttnbp2B9EJA2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cttnbp2B9EJA2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms