Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd8B9EJ80 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms